구조 적응형 모델 예측 제어는 시스템의 동작 특성이나 구조 자체가 시간이 지나면서 변할 때, 모델의 구조를 동적으로 바꾸어 예측 성능을 유지하는 방법이다. 예를 들어, 시스템이 특정 시점에서 선형적 특성을 보이다가 비선형적인 특성으로 변화하는 경우, MPC 모델의 구조를 선형에서 비선형으로 전환하는 방식으로 대응할 수 있다. 이를 통해 시스템의 비정상적 동작이나 극단적인 변화에도 적응할 수 있는 유연성을 확보한다.

구조 적응형 모델 예측 제어는 복잡한 동적 시스템에서 유용하며, 특히 비선형 제어나 시간에 따라 달라지는 시스템에서 효과적이다. 이 방식은 고성능을 유지할 수 있지만, 모델의 구조를 바꾸는 과정에서 추가적인 계산 자원이 필요할 수 있다.